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黑崎真冬曾經是不良少女。因為打架而被退學，之後轉學到綠丘學園，她決定洗心革面，當個青春洋溢的高中生！她還交到第一位朋友早?，平靜的生活原本要展開，可是班導佐伯老師其實是她的…!?目標,令人嚮往的高中生活
故事發生在二十一世紀末的日本。魔法，這不是一個傳說，而是現代科學的一項技術，它被應用至今已經過瞭一個世紀。曾經被稱為“超能力”的先天具有的能力被以“魔法”這個名字的體系替代，高超的的魔法師被認為是國傢的實力。西歷 2095 年的春天，新生入學的季節。國立魔法大學附屬第一高校——通稱“魔法科高校”，是由成績優秀的“一科生”，和作為一科生替補的“二科生”所構成，他們也各自被冠上瞭“花冠（bloom）”，以及“雜草（weed）”之名。就在這樣的魔法科高校裡，一對兄妹入學瞭。兄長是，擁有著缺陷的劣等生。妹妹是，完美無缺的的優等生。無論什麼事都抱著達觀態度的劣等生兄長，和對他抱著作為血親以上感情的優等生妹妹。隨著這兩人進入這間精英學校的大門，這平穩的學院，也開始瞭騷亂的日常。
四月一日同學命裡缺我漫畫，才色兼備的女高中生四月一日蕾拉是公認的潔癖女。某日，因為目擊到同年級的人氣帥哥三月終令人難以置信的一面，於是開始遭遇眾多（嗶——）的試煉……！